Viruso mutacijos

Pasidalinkite su draugais

Susirūpinimo variantai (LOJ)

Yra aiškių įrodymų, kad šie variantai daro didelį poveikį užkrečiamumui, sunkumui ir (arba) imunitetui, kuris gali turėti įtakos epidemiologinei padėčiai ES/EEE. Sujungti šių savybių genominiai, epidemiologiniai ir in vitro įrodymai reikalauja bent vidutinio pasitikėjimo. Be to, taikomi visi toliau nurodyti dominančių ir stebimų variantų kriterijai.

PSO etiketė Linija + papildomos mutacijos Pirmą kartą aptikta šalis (bendruomenė) Dominančios smaigalio mutacijos Pirmą kartą aptikti metai ir mėnuo Poveikio užkrečiamumui įrodymai Poveikio imunitetui įrodymai Poveikio sunkumui įrodymai Perdavimas ES/EEE
 

Beta

B.1.351 pietų Afrika K417N, E484K, N501Y, D614G, A701V 2020 m. rugsėjo mėn Taip (v) (1) Taip (v) (2, 3) Taip (v) (4, 5) bendruomenė
 

Gama

P.1 Brazilija K417T, E484K, N501Y, D614G, H655Y 2020 m. gruodžio mėn Taip (v) (6) Taip (v) (7)  Taip (v) (5) bendruomenė
 

Delta

B.1.617.2 Indija L452R, T478K, D614G, P681R 2020 m. gruodžio mėn Taip (v) (8) Taip (v) (9–11) Taip (v) (10, 12) Dominuojantis
Omikronas
B.1.1.529
Pietų Afrika ir Botsvana (x) 2021 m. lapkritis Pavieniai / Kelionės

 

x: A67V, Δ69-70, T95I, G142D, Δ143-145, Δ211-212, ins214EPE, G339D, S371L, S373P, S375F, K417N, N440K, G47A, 498, 448, 440 Y505H, T547K, D614G, H655Y, N679K, P681H, N764K, D796Y, N856K, Q954H, N969K, L981F

Į variantą taip pat įtrauktos visos išvardintų giminių porūšiai, pvz., C.37.1 yra įtrauktas į Lambda, nes tai yra C.37 pogrupis.

Dominantys variantai (VOI)

Yra duomenų apie šių variantų genomines savybes, epidemiologinius įrodymus arba in vitro įrodymus, kurie gali reikšti didelį poveikį užkrečiamumui, sunkumui ir (arba) imunitetui, realiai turėdami įtakos epidemiologinei situacijai ES/EEE. Tačiau įrodymai vis dar yra preliminarūs arba yra susiję su dideliu netikrumu. Be to, taikomi visi toliau aprašyti stebimų variantų kriterijai.

PSO etiketė Linija + papildomos mutacijos Pirmą kartą aptikta šalis (bendruomenė) Dominančios smaigalio mutacijos Pirmą kartą aptikti metai ir mėnuo Poveikio užkrečiamumui įrodymai Poveikio imunitetui įrodymai Poveikio sunkumui įrodymai Perdavimas ES/EEE
Mu B.1.621 Kolumbija R346K, E484K, N501Y, D614G, P681H 2021 m. sausio mėn Taip (m) (13) Taip (m) (14)   Pavieniai / Kelionės
Lambda C.37 Peru L452Q, F490S, D614G 2020 m. gruodžio mėn   Taip (v) (15, 16)   Pavieniai / Kelionės
n/a AY.4.2 Jungtinė Karalystė L452R, T478K, D614G, P681R, A222V, Y145H 2021 m. birželio mėn Taip (v) (17) Ne (v) (17, 18) Ne (v) (17) bendruomenė

 

n/a: netaikoma, šiuo metu šiam variantui nepriskirta jokia PSO etiketė

Į variantą taip pat įtrauktos visos išvardintų giminių polines, pvz., AZ.1 yra įtrauktas į B.1.1.318, nes tai yra jo pogrupis.

Stebimi variantai

Šie papildomi SARS-CoV-2 variantai buvo aptikti kaip signalai per epidemijos žvalgybą, taisyklėmis pagrįstą genomo variantų atranką arba preliminarius mokslinius įrodymus. Yra tam tikrų požymių, kad jų savybės gali būti panašios į LOJ, tačiau įrodymai yra silpni arba ECDC jų dar neįvertino. Čia išvardyti variantai turi būti bent viename protrūkyje, aptiktame ES/EEE bendruomenėje, arba turi būti įrodymų, kad kitoje pasaulio vietoje variantas yra perduodamas bendruomenei.

PSO etiketė Linija + papildomos mutacijos Pirmą kartą aptikta šalis (bendruomenė) Dominančios smaigalio mutacijos Pirmą kartą aptikti metai ir mėnuo Poveikio užkrečiamumui įrodymai Poveikio imunitetui įrodymai Poveikio sunkumui įrodymai Perdavimas ES/EEE
n/a C.36 +L452R Egiptas L452R, D614G, Q677H 2020 m. gruodžio mėn   Taip (m) (19)   Aptikta (a)
n/a B.1.1.318 Neaišku (b) E484K, D614G, P681H 2021 m. sausio mėn   Taip (m) (14)   Aptikta (a)
n/a P.1 +P681H Italija D614G, E484K, H655Y, K417T, N501Y, P681H 2021 m. vasario mėn   Neaišku (20, 21)   Aptikta (a)
n/a B.1.617.2 + K417N Jungtinė Karalystė L452R, T478K, D614G, P681R, K417N 2021 m. birželio mėn       Aptikta (a)
n/a C.1.2 pietų Afrika D614G, E484K, H655Y, N501Y, N679K, Y449H 2021 m. birželio mėn Taip (m) (13) Taip (m) (14)   Aptikta (a)
n/a B.1.617.2 + E484X (d) Indija L452R, T478K, D614G, P681R, E484X (d) 2021 m. balandžio mėn       Aptikta (a)
n/a B.1.617.2 + Q613H Indija L452R, T478K, D614G, P681R, Q613H 2021 m. balandžio mėn       Aptikta (a)
n/a B.1.617.2 + Q677H Indija L452R, T478K, D614G, P681R, Q677H 2021 m. balandžio mėn       Aptikta (a)
n/a B.1.640 Kongo Respublika D614G, F490R, N394S, N501Y, P681H, R346S, Y449N, 137–145del 2021 m. rugsėjo mėn       Aptikta (a)

n/a: netaikoma, šiuo metu šiam variantui nepriskirta jokia PSO etiketė

Į variantą taip pat įtrauktos visos išvardintų giminių polines, pvz., AZ.1 yra įtrauktas į B.1.1.318, nes tai yra jo pogrupis.

Deeskaluoti variantai

Šie papildomi SARS-CoV-2 variantai buvo sumažinti, remiantis bent vienu iš šių kriterijų: (1) variantas nebeplatinamas, (2) variantas cirkuliuoja ilgą laiką ir neturėjo jokio poveikio bendra epidemiologinė padėtis, (3) moksliniai įrodymai rodo, kad variantas nėra susijęs su jokiomis susijusiomis savybėmis.

PSO etiketė Linija + papildomos mutacijos Pirmą kartą aptikta šalis (bendruomenė) Dominančios smaigalio mutacijos Pirmą kartą aptikti metai ir mėnuo Poveikio užkrečiamumui įrodymai Poveikio imunitetui įrodymai Poveikio sunkumui įrodymai Deeskalavimo priežastis
 

Alfa

B.1.1.7 Jungtinė Karalystė N501Y, D614G, P681H 2020 m. rugsėjo mėn Taip (v) (13) Nr Taip (v) (5, 22) Drastiškai sumažėjusi apyvarta ES/EEE po Delta atsiradimo; mažai įrodymų apie poveikį vakcinos sukeltam imunitetui
 

n/a

B.1.1.7 +E484K Jungtinė Karalystė E484K, N501Y, D614G, P681H 2020 m. gruodžio mėn Taip (v) (13) Taip (v) (14, 23) Taip (v) (22) Labai mažas apyvartos lygis ES/EEE
Epsilonas B.1.427 / B.1.429 JAV L452R, D614G 2020 m. rugsėjo mėn Neaišku (19) Taip (v) (19)   ES/EEE nebeaptikta arba aptikta itin mažu lygiu, o turimi duomenys rodo, kad vakcinos ir gydymas yra veiksmingi prieš tokį variantą.
n/a B.1.616 (c) Prancūzija V483A, D614G, H655Y, G669S 2021 m. vasario mėn Aptikimas (c) (24)     Neaptikta nuo 2021-04-23 (25)
Eta B.1.525 Nigerija E484K, D614G, Q677H 2020 m. gruodžio mėn   Taip (m) (14, 26)     ES/EEE nebeaptikta arba aptikta itin mažu lygiu
Teta P.3 Filipinai E484K, N501Y, D614G, P681H 2021 m. sausio mėn Taip (m) (13) Taip (m) (14)   ES/EEE nebeaptikta arba aptikta itin mažu lygiu
Kapa B.1.617.1 Indija L452R, E484Q, D614G, P681R 2020 m. gruodžio mėn Taip (v) (27) Taip (v) (28–31)   ES/EEE nebeaptikta arba aptikta itin mažu lygiu
n/a B.1.620 Neaišku (b) S477N, E484K, D614G, P681H 2021 m. vasario mėn   Taip (m) (14, 32)   ES/EEE nebeaptikta arba aptikta itin mažu lygiu
n/a B.1.617.3 Indija L452R, E484Q, D614G, P681R 2021 m. vasario mėn Taip (m) [1] Taip (m) (14, 19)   ES/EEE nebeaptikta arba aptikta itin mažu lygiu
n/a B.1.214.2 Neaišku 2 Q414K, N450K, ins214TDR, D614G 2020 m. gruodžio mėn       ES/EEE nebeaptikta arba aptikta itin mažu lygiu
n/a A.23.1 +E484K Jungtinė Karalystė V367F, E484K, Q613H 2020 m. gruodžio mėn   Taip (m) (14)   ES/EEE nebeaptikta arba aptikta itin mažu lygiu
n/a A.27 Neaišku (b) L452R, N501Y, A653V, H655Y 2020 m. gruodžio mėn Taip (m) (13) Taip (m) (19)   ES/EEE nebeaptikta arba aptikta itin mažu lygiu
n/a A.28 Neaišku (b) E484K, N501T, H655Y 2020 m. gruodžio mėn   Taip (m) (14)   ES/EEE nebeaptikta arba aptikta itin mažu lygiu
n/a C.16 Neaišku (b) L452R, D614G 2020 m. spalio mėn   Taip (m) (14)   ES/EEE nebeaptikta arba aptikta itin mažu lygiu
n/a B.1.351 +P384L pietų Afrika P384L, K417N, E484K, N501Y, D614G, A701V 2020 m. gruodžio mėn Taip (v) (1) Taip (v) (2, 3) Neaišku (4) ES/EEE nebeaptikta arba aptikta itin mažu lygiu
n/a B.1.351 +E516Q Neaišku (b) K417N, E484K, N501Y, E516Q, D614G, A701V 2021 m. sausio mėn Taip (v) (1) Taip (v) (2, 3) Neaišku (4) ES/EEE nebeaptikta arba aptikta itin mažu lygiu
n/a B.1.1.7 +L452R Jungtinė Karalystė L452R, N501Y, D614G, P681H 2021 m. sausio mėn Taip (v) (13) Taip (m) (19) Taip (v) (22) ES/EEE nebeaptikta arba aptikta itin mažu lygiu
n/a B.1.1.7 +S494P Jungtinė Karalystė S494P, N501Y, D614G, P681H 2021 m. sausio mėn Taip (v) (13) Taip (m) (33) Taip (v) (22) ES/EEE nebeaptikta arba aptikta itin mažu lygiu
Iota B.1.526 JAV  E484K, D614G, A701V 2020 m. gruodžio mėn   Taip (m) (14)   ES/EEE nebeaptikta arba aptikta itin mažu lygiu
n/a B.1.526.1 JAV L452R, D614G 2020 m. spalio mėn   Taip (m) (19)   Iš Pango atimta giminė
n/a B.1.526.2 JAV S477N, D614G 2020 m. gruodžio mėn       Iš Pango atimta giminė
Zeta P.2 Brazilija E484K, D614G 2021 m. sausio mėn   Taip (m) (14)   ES/EEE nebeaptikta arba aptikta itin mažu lygiu
n/a B.1.1.519 Meksika T478K, D614G 2020 m. lapkritis   Taip (m) (19)   ES/EEE nebeaptikta arba aptikta itin mažu lygiu
n/a AV.1 Jungtinė Karalystė N439K, E484K, D614G, P681H 2021 m. kovo mėn   Taip (m) (14)   ES/EEE nebeaptikta arba aptikta itin mažu lygiu
n/a AT.1 Rusija E484K, D614G, N679K, ins679GIAL 2021 m. sausio mėn   Taip (m) (14)   ES/EEE nebeaptikta arba aptikta itin mažu lygiu

n/a: netaikoma, šiuo metu šiam variantui nepriskirta jokia PSO etiketė

Į variantą taip pat įtrauktos visos išvardintų giminių porūšiai, pvz., B.1.429.1 yra įtrauktas į B.1.427/B.1.429, nes tai yra B.1.429 pogrupis.

a) Stebėsenos kategorijos variantų perdavimo įvertinimas nėra pateiktas, tik aptikta / neaptikta.

b) Ankstyviausi aptikimai iš kelių skirtingų šalių yra artimi laikui ir nėra aiškiai įrodomos kelionės į konkrečią šalį sąsajos, kuri paaiškintų aptikimus.

c) Susirūpinimą dėl šio varianto kėlė tai, kad yra pranešimų apie sunkumus, susijusius su jo aptikimu viršutinių kvėpavimo takų mėginiuose. Šiuos sunkumus sukėlė ne pradmenų ir šablonų neatitikimas, o viruso nepakankamas kiekis viršutiniuose kvėpavimo takuose.

d) bet koks aminorūgščių pakeitimas


Pasidalinkite su draugais
Naujienos

TRUMPAI


Yra 7 koronavirusų šeimai priklausantys virusai. Jie pavadinti taip todėl, nes yra panašūs į karūną, o žodis „korona“ lotynų kalboje būtent tai ir reiškia. Iš šių 7 koronavirusų pavojingiausi yra trys, pasaulyje sukėlę protrūkius.

Pirmąjį protrūkį prieš 18 metų lėmė SŪRS virusas – sunkus ūminis respiracinis sindromas. Antrąjį protrūkį prieš 8 metus sukėlė MERS virusas – jis kilo Artimuosiuose Rytuose. Trečiasis protrūkis 2020 m. sausio mėnesį prasidėjo Kinijoje.