Susirūpinimo variantai (LOJ)
Yra aiškių įrodymų, kad šie variantai daro didelį poveikį užkrečiamumui, sunkumui ir (arba) imunitetui, kuris gali turėti įtakos epidemiologinei padėčiai ES/EEE. Sujungti šių savybių genominiai, epidemiologiniai ir in vitro įrodymai reikalauja bent vidutinio pasitikėjimo. Be to, taikomi visi toliau nurodyti dominančių ir stebimų variantų kriterijai.
| PSO etiketė | Linija + papildomos mutacijos | Pirmą kartą aptikta šalis (bendruomenė) | Dominančios smaigalio mutacijos | Pirmą kartą aptikti metai ir mėnuo | Poveikio užkrečiamumui įrodymai | Poveikio imunitetui įrodymai | Poveikio sunkumui įrodymai | Perdavimas ES/EEE | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
|
Beta |
B.1.351 | pietų Afrika | K417N, E484K, N501Y, D614G, A701V | 2020 m. rugsėjo mėn | Taip (v) (1) | Taip (v) (2, 3) | Taip (v) (4, 5) | bendruomenė | |
|
Gama |
P.1 | Brazilija | K417T, E484K, N501Y, D614G, H655Y | 2020 m. gruodžio mėn | Taip (v) (6) | Taip (v) (7) | Taip (v) (5) | bendruomenė | |
|
Delta |
B.1.617.2 | Indija | L452R, T478K, D614G, P681R | 2020 m. gruodžio mėn | Taip (v) (8) | Taip (v) (9–11) | Taip (v) (10, 12) | Dominuojantis | |
| Omikronas |
|
Pietų Afrika ir Botsvana | (x) | 2021 m. lapkritis | Pavieniai / Kelionės |
x: A67V, Δ69-70, T95I, G142D, Δ143-145, Δ211-212, ins214EPE, G339D, S371L, S373P, S375F, K417N, N440K, G47A, 498, 448, 440 Y505H, T547K, D614G, H655Y, N679K, P681H, N764K, D796Y, N856K, Q954H, N969K, L981F
Į variantą taip pat įtrauktos visos išvardintų giminių porūšiai, pvz., C.37.1 yra įtrauktas į Lambda, nes tai yra C.37 pogrupis.
Dominantys variantai (VOI)
Yra duomenų apie šių variantų genomines savybes, epidemiologinius įrodymus arba in vitro įrodymus, kurie gali reikšti didelį poveikį užkrečiamumui, sunkumui ir (arba) imunitetui, realiai turėdami įtakos epidemiologinei situacijai ES/EEE. Tačiau įrodymai vis dar yra preliminarūs arba yra susiję su dideliu netikrumu. Be to, taikomi visi toliau aprašyti stebimų variantų kriterijai.
| PSO etiketė | Linija + papildomos mutacijos | Pirmą kartą aptikta šalis (bendruomenė) | Dominančios smaigalio mutacijos | Pirmą kartą aptikti metai ir mėnuo | Poveikio užkrečiamumui įrodymai | Poveikio imunitetui įrodymai | Poveikio sunkumui įrodymai | Perdavimas ES/EEE |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Mu | B.1.621 | Kolumbija | R346K, E484K, N501Y, D614G, P681H | 2021 m. sausio mėn | Taip (m) (13) | Taip (m) (14) | Pavieniai / Kelionės | |
| Lambda | C.37 | Peru | L452Q, F490S, D614G | 2020 m. gruodžio mėn | Taip (v) (15, 16) | Pavieniai / Kelionės | ||
| n/a | AY.4.2 | Jungtinė Karalystė | L452R, T478K, D614G, P681R, A222V, Y145H | 2021 m. birželio mėn | Taip (v) (17) | Ne (v) (17, 18) | Ne (v) (17) | bendruomenė |
n/a: netaikoma, šiuo metu šiam variantui nepriskirta jokia PSO etiketė
Į variantą taip pat įtrauktos visos išvardintų giminių polines, pvz., AZ.1 yra įtrauktas į B.1.1.318, nes tai yra jo pogrupis.
Stebimi variantai
Šie papildomi SARS-CoV-2 variantai buvo aptikti kaip signalai per epidemijos žvalgybą, taisyklėmis pagrįstą genomo variantų atranką arba preliminarius mokslinius įrodymus. Yra tam tikrų požymių, kad jų savybės gali būti panašios į LOJ, tačiau įrodymai yra silpni arba ECDC jų dar neįvertino. Čia išvardyti variantai turi būti bent viename protrūkyje, aptiktame ES/EEE bendruomenėje, arba turi būti įrodymų, kad kitoje pasaulio vietoje variantas yra perduodamas bendruomenei.
| PSO etiketė | Linija + papildomos mutacijos | Pirmą kartą aptikta šalis (bendruomenė) | Dominančios smaigalio mutacijos | Pirmą kartą aptikti metai ir mėnuo | Poveikio užkrečiamumui įrodymai | Poveikio imunitetui įrodymai | Poveikio sunkumui įrodymai | Perdavimas ES/EEE |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| n/a | C.36 +L452R | Egiptas | L452R, D614G, Q677H | 2020 m. gruodžio mėn | Taip (m) (19) | Aptikta (a) | ||
| n/a | B.1.1.318 | Neaišku (b) | E484K, D614G, P681H | 2021 m. sausio mėn | Taip (m) (14) | Aptikta (a) | ||
| n/a | P.1 +P681H | Italija | D614G, E484K, H655Y, K417T, N501Y, P681H | 2021 m. vasario mėn | Neaišku (20, 21) | Aptikta (a) | ||
| n/a | B.1.617.2 + K417N | Jungtinė Karalystė | L452R, T478K, D614G, P681R, K417N | 2021 m. birželio mėn | Aptikta (a) | |||
| n/a | C.1.2 | pietų Afrika | D614G, E484K, H655Y, N501Y, N679K, Y449H | 2021 m. birželio mėn | Taip (m) (13) | Taip (m) (14) | Aptikta (a) | |
| n/a | B.1.617.2 + E484X (d) | Indija | L452R, T478K, D614G, P681R, E484X (d) | 2021 m. balandžio mėn | Aptikta (a) | |||
| n/a | B.1.617.2 + Q613H | Indija | L452R, T478K, D614G, P681R, Q613H | 2021 m. balandžio mėn | Aptikta (a) | |||
| n/a | B.1.617.2 + Q677H | Indija | L452R, T478K, D614G, P681R, Q677H | 2021 m. balandžio mėn | Aptikta (a) | |||
| n/a | B.1.640 | Kongo Respublika | D614G, F490R, N394S, N501Y, P681H, R346S, Y449N, 137–145del | 2021 m. rugsėjo mėn | Aptikta (a) |
n/a: netaikoma, šiuo metu šiam variantui nepriskirta jokia PSO etiketė
Į variantą taip pat įtrauktos visos išvardintų giminių polines, pvz., AZ.1 yra įtrauktas į B.1.1.318, nes tai yra jo pogrupis.
Deeskaluoti variantai
Šie papildomi SARS-CoV-2 variantai buvo sumažinti, remiantis bent vienu iš šių kriterijų: (1) variantas nebeplatinamas, (2) variantas cirkuliuoja ilgą laiką ir neturėjo jokio poveikio bendra epidemiologinė padėtis, (3) moksliniai įrodymai rodo, kad variantas nėra susijęs su jokiomis susijusiomis savybėmis.
| PSO etiketė | Linija + papildomos mutacijos | Pirmą kartą aptikta šalis (bendruomenė) | Dominančios smaigalio mutacijos | Pirmą kartą aptikti metai ir mėnuo | Poveikio užkrečiamumui įrodymai | Poveikio imunitetui įrodymai | Poveikio sunkumui įrodymai | Deeskalavimo priežastis |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
|
Alfa |
B.1.1.7 | Jungtinė Karalystė | N501Y, D614G, P681H | 2020 m. rugsėjo mėn | Taip (v) (13) | Nr | Taip (v) (5, 22) | Drastiškai sumažėjusi apyvarta ES/EEE po Delta atsiradimo; mažai įrodymų apie poveikį vakcinos sukeltam imunitetui |
|
n/a |
B.1.1.7 +E484K | Jungtinė Karalystė | E484K, N501Y, D614G, P681H | 2020 m. gruodžio mėn | Taip (v) (13) | Taip (v) (14, 23) | Taip (v) (22) | Labai mažas apyvartos lygis ES/EEE |
| Epsilonas | B.1.427 / B.1.429 | JAV | L452R, D614G | 2020 m. rugsėjo mėn | Neaišku (19) | Taip (v) (19) | ES/EEE nebeaptikta arba aptikta itin mažu lygiu, o turimi duomenys rodo, kad vakcinos ir gydymas yra veiksmingi prieš tokį variantą. | |
| n/a | B.1.616 (c) | Prancūzija | V483A, D614G, H655Y, G669S | 2021 m. vasario mėn | Aptikimas (c) (24) | Neaptikta nuo 2021-04-23 (25) | ||
| Eta | B.1.525 | Nigerija | E484K, D614G, Q677H | 2020 m. gruodžio mėn | Taip (m) (14, 26) | ES/EEE nebeaptikta arba aptikta itin mažu lygiu | ||
| Teta | P.3 | Filipinai | E484K, N501Y, D614G, P681H | 2021 m. sausio mėn | Taip (m) (13) | Taip (m) (14) | ES/EEE nebeaptikta arba aptikta itin mažu lygiu | |
| Kapa | B.1.617.1 | Indija | L452R, E484Q, D614G, P681R | 2020 m. gruodžio mėn | Taip (v) (27) | Taip (v) (28–31) | ES/EEE nebeaptikta arba aptikta itin mažu lygiu | |
| n/a | B.1.620 | Neaišku (b) | S477N, E484K, D614G, P681H | 2021 m. vasario mėn | Taip (m) (14, 32) | ES/EEE nebeaptikta arba aptikta itin mažu lygiu | ||
| n/a | B.1.617.3 | Indija | L452R, E484Q, D614G, P681R | 2021 m. vasario mėn | Taip (m) [1] | Taip (m) (14, 19) | ES/EEE nebeaptikta arba aptikta itin mažu lygiu | |
| n/a | B.1.214.2 | Neaišku 2 | Q414K, N450K, ins214TDR, D614G | 2020 m. gruodžio mėn | ES/EEE nebeaptikta arba aptikta itin mažu lygiu | |||
| n/a | A.23.1 +E484K | Jungtinė Karalystė | V367F, E484K, Q613H | 2020 m. gruodžio mėn | Taip (m) (14) | ES/EEE nebeaptikta arba aptikta itin mažu lygiu | ||
| n/a | A.27 | Neaišku (b) | L452R, N501Y, A653V, H655Y | 2020 m. gruodžio mėn | Taip (m) (13) | Taip (m) (19) | ES/EEE nebeaptikta arba aptikta itin mažu lygiu | |
| n/a | A.28 | Neaišku (b) | E484K, N501T, H655Y | 2020 m. gruodžio mėn | Taip (m) (14) | ES/EEE nebeaptikta arba aptikta itin mažu lygiu | ||
| n/a | C.16 | Neaišku (b) | L452R, D614G | 2020 m. spalio mėn | Taip (m) (14) | ES/EEE nebeaptikta arba aptikta itin mažu lygiu | ||
| n/a | B.1.351 +P384L | pietų Afrika | P384L, K417N, E484K, N501Y, D614G, A701V | 2020 m. gruodžio mėn | Taip (v) (1) | Taip (v) (2, 3) | Neaišku (4) | ES/EEE nebeaptikta arba aptikta itin mažu lygiu |
| n/a | B.1.351 +E516Q | Neaišku (b) | K417N, E484K, N501Y, E516Q, D614G, A701V | 2021 m. sausio mėn | Taip (v) (1) | Taip (v) (2, 3) | Neaišku (4) | ES/EEE nebeaptikta arba aptikta itin mažu lygiu |
| n/a | B.1.1.7 +L452R | Jungtinė Karalystė | L452R, N501Y, D614G, P681H | 2021 m. sausio mėn | Taip (v) (13) | Taip (m) (19) | Taip (v) (22) | ES/EEE nebeaptikta arba aptikta itin mažu lygiu |
| n/a | B.1.1.7 +S494P | Jungtinė Karalystė | S494P, N501Y, D614G, P681H | 2021 m. sausio mėn | Taip (v) (13) | Taip (m) (33) | Taip (v) (22) | ES/EEE nebeaptikta arba aptikta itin mažu lygiu |
| Iota | B.1.526 | JAV | E484K, D614G, A701V | 2020 m. gruodžio mėn | Taip (m) (14) | ES/EEE nebeaptikta arba aptikta itin mažu lygiu | ||
| n/a | B.1.526.1 | JAV | L452R, D614G | 2020 m. spalio mėn | Taip (m) (19) | Iš Pango atimta giminė | ||
| n/a | B.1.526.2 | JAV | S477N, D614G | 2020 m. gruodžio mėn | Iš Pango atimta giminė | |||
| Zeta | P.2 | Brazilija | E484K, D614G | 2021 m. sausio mėn | Taip (m) (14) | ES/EEE nebeaptikta arba aptikta itin mažu lygiu | ||
| n/a | B.1.1.519 | Meksika | T478K, D614G | 2020 m. lapkritis | Taip (m) (19) | ES/EEE nebeaptikta arba aptikta itin mažu lygiu | ||
| n/a | AV.1 | Jungtinė Karalystė | N439K, E484K, D614G, P681H | 2021 m. kovo mėn | Taip (m) (14) | ES/EEE nebeaptikta arba aptikta itin mažu lygiu | ||
| n/a | AT.1 | Rusija | E484K, D614G, N679K, ins679GIAL | 2021 m. sausio mėn | Taip (m) (14) | ES/EEE nebeaptikta arba aptikta itin mažu lygiu |
n/a: netaikoma, šiuo metu šiam variantui nepriskirta jokia PSO etiketė
Į variantą taip pat įtrauktos visos išvardintų giminių porūšiai, pvz., B.1.429.1 yra įtrauktas į B.1.427/B.1.429, nes tai yra B.1.429 pogrupis.
a) Stebėsenos kategorijos variantų perdavimo įvertinimas nėra pateiktas, tik aptikta / neaptikta.
b) Ankstyviausi aptikimai iš kelių skirtingų šalių yra artimi laikui ir nėra aiškiai įrodomos kelionės į konkrečią šalį sąsajos, kuri paaiškintų aptikimus.
c) Susirūpinimą dėl šio varianto kėlė tai, kad yra pranešimų apie sunkumus, susijusius su jo aptikimu viršutinių kvėpavimo takų mėginiuose. Šiuos sunkumus sukėlė ne pradmenų ir šablonų neatitikimas, o viruso nepakankamas kiekis viršutiniuose kvėpavimo takuose.
d) bet koks aminorūgščių pakeitimas
