Ketvirtame pagal dydį Jungtinių Amerikos Valstijų miesto Hiustone medicinos įstaigų tinklo darbuotojai papasakojo, kuo skiriasi pacientai, užsikrėtę omikrono paderme, nuo pacientų, sergančių SARS-CoV „delta“ ir „britišku“ variantu. 2.
Pirmojo amerikiečių recenzuoto tyrimo, kuriame dalyvavo pacientai, sergantys omikrono koronavirusu Hiustono metodistų ligoninėje, autoriai nustatė jiems būdingus skirtumus nuo pacientų, sergančių „delta“ arba „britišku“ variantu („alfa“). Ataskaita paskelbta The American Journal of Pathology .
2020 m. vasario mėn. pabaigoje, pačioje Covid-19 pandemijos pradžioje, Hiustone, Teksase, The Methodist Hospital System pradėjo masinį populiacijos genomikos projektą, kurio tikslas buvo suskirstyti visus SARS-CoV-2 mėginius, paimtus iš pacientų gydyti vietinėse įstaigose. Tikslas – visapusiškai atsekti epidemijos raidą Hiustone, kuriame gyvena apie 7,2 mln. Tai ketvirtas pagal dydį miestas Jungtinėse Amerikos Valstijose ir etniniu požiūriu pati įvairiausia metropolinė zona šalyje. Šiandien duomenų bazėje saugomi daugiau nei 70 tūkstančių žmonių pavyzdžiai.
Po alfa ir delta padermių sukeltų ligų bangų valdžiai atrodė, kad epidemija ėmė trauktis. Tačiau 2021 m. pabaigoje „omikronas“ sparčiai išplito visame pasaulyje. Lapkričio 27 – sausio 5 dienomis Hiustono metodistų ligoninių sistema, tai yra ligoninėse ir skubios pagalbos centruose, užregistravo 4 468 pacientus, sergančius simptomine koronaviruso liga, kurią sukėlė naujas patogeno variantas. Tyrimo pabaigoje omikronas buvo atsakingas už 90% naujų Covid-19 atvejų.
Atlikdami lyginamąją analizę, gydytojai į imtį įtraukė ir vietinius pacientus, sergančius alfa ir delta padermėmis, kurie anksčiau buvo gydomi. Dėl to tyrimo metu buvo atsižvelgta į informaciją apie 40 991 asmenį. Pirmasis omikrono infekcijos atvejis buvo nustatytas 2021 metų lapkričio pabaigoje, kai dominavo delta, tuo pačiu laikotarpiu bendras Covid-19 pacientų skaičius regione nuolat mažėjo. Tačiau iki gruodžio 23 d. genomo sekos nustatymo duomenys parodė, kad Omicron sudarė daugiau nei 90% visų naujų atvejų.
„Apskaičiuotas atvejų skaičiaus padvigubėjimo laikas per tris savaites buvo maždaug 1,8 dienos, o tai reiškia, kad santykinis omikrono padermės dažnis padidėjo maždaug tris kartus greičiau nei delta varianto“, – rašo autoriai. Tuo pačiu metu didžioji dauguma užsikrėtusiųjų nepaliko JAV: tai yra, jie užsikrėtė „omikronu“ šalies viduje.
Kaip paaiškėjo, pacientai, sergantys omikrono paderme, buvo keleriais metais jaunesni nei sergantys SARS-CoV-2 alfa arba delta variantu: pirmųjų vidutinis amžius buvo 44,3 metų, 57,8% moterų. Be to, jiems (užsikrėstiems „omikronu “) rečiau prireikdavo hospitalizuoti, o jei jie patekdavo į ligonines gydytis, jie ten praleisdavo daug mažiau laiko: 3,2 dienos vietoj 5,1 dienos „alfa “ atveju ir 5,4 dienos deltos “.
Per tyrimo laikotarpį mirė 38 pacientai, turintys omikrono padermę, ty 99,1% pasveiko (palyginti su 170, kurie mirė nuo britų padermės (94,6% išgyveno) ir 839 su „delta ” (94,7% išgyveno). Tik vienam pacientui su „omikronu“ prireikė ekstrakorporinės membranos deguonies (invazinis kraujo prisotinimo deguonimi metodas), 49 – mechaninės ventiliacijos.
Pacientai, sergantys omikrono paderme, buvo dažniau skiepijami: neskiepyti buvo tik 1815 žmonių (40,6%), palyginti su 11 415 pacientų, sergančių „delta “ (72,6%). Vadinamojo britiško varianto atveju visą vakcinacijos kursą ligos metu baigė tik 101 žmogus (3,2 proc.). Iš viso 156 žmonės (3,5 %) užsikrėtė Omicron praėjus mažiausiai savaitei po pirmosios vakcinacijos, 1786 (40 %) – praėjus 14 dienų po antrosios, 711 (15,9 %) – praėjus mažiausiai dviem savaitėms po revakcinacijos (revakcinacijos). ). Lyginant su delta paderme, skaičiai yra tokie: atitinkamai 494 (3,1%), 3679 (23,4%) ir 140 (0,9%) žmonių.
Mokslininkai taip pat patikrino visas savo duomenų bazėje esančias visas genomo sekas ir dviejuose žmonėse aptiko omikrono padermės BA.2 subvariantą. Stealth omicron dar tik pradėjo plisti visame pasaulyje, nors kai kuriose šalyse – pavyzdžiui, Danijoje – jis jau dominuoja.
