Mokslininkai ištyrė BA.1 ir BA.2 omikronų subvariantus ir išbandė jų gebėjimą prisijungti prie žmogaus, pelės ir katės ACE2 membranos baltymo. Galų gale jie padarė išvadą, kad pelė buvo pagrindinė „omikrono“ evoliucijos šeimininkė, kuri praeidavo per katę, grįždavo į pelę, o paskui persikėlė į žmones.
Pasaulio sveikatos organizacija kovo 22 d. paskelbė, kad omicron padermės BA.2 subvariantas tapo dominuojančia SARS-CoV-2, viruso, sukeliančio Covid-19, forma visame pasaulyje. BA.2 turi daug genetinių panašumų su savo artimu giminaičiu BA.1, dėl kurio pastaraisiais mėnesiais paplitimas visame pasaulyje išaugo.
Tačiau BA.2 yra 30-50 procentų labiau užkrečiamas nei BA.1. Jis greitai išplito visame pasaulyje ir tapo dominuojančiu variantu dėl didesnio užkrečiamumo.
Spygliuočių baltymas yra S baltymas, sudarantis koronaviruso apvalkalą ir su kuriuo jis prilimpa prie žmogaus ląstelių. Kinijos mokslininkai biochemiškai išanalizavo BA.2 smaigalio baltymo jungimosi afinitetą su žmogaus ACE2 fermentu: jų darbas parodė, kad afinitetas yra maždaug du kartus didesnis nei BA.1 ir 11 kartų didesnis nei WT padermės (laukinio tipo) afinitetas.
Spygliuočių baltymo sąveika su ACE2 yra pirmasis viruso prisijungimo prie šeimininko receptoriaus žingsnis, kuris yra labai svarbus patogeno patekimui ir vėlesnėms infekcijoms. Taigi didesnis BA.2 smaigalio baltymo surišimo pajėgumas tikriausiai nulemia ypatingą jo perduodamumą.
Be to, tyrimo rezultatai padėjo nustatyti galimą pirminį BA.1 ir BA.2 šeimininką. Buvo pranešta, kad Omicron išsivystė nepriklausomai nuo visų kitų koronaviruso padermių, o jo kilmė lieka paslaptis. Norint veiksmingai kontroliuoti ir užkirsti kelią Covid-19 žmonių populiacijai, labai svarbu ištirti BA.1 ir BA.2 kilmę.
Mutacijų profiliavimo analizė rodo, kad „omikronų“ variantai galėjo išsivystyti per pelę kaip šeimininką. Naujame tyrime biocheminiai duomenys patvirtino, kad BA.1 ir BA.2 smaigalių baltymai gali dideliu afinitetu prisijungti prie pelių ir kačių ACE2. Tuo pačiu metu WT padermės smaigalys baltymas gerai jungiasi su katės ACE2, bet nesijungia su pelės ACE2. Tai rodo didelį pelių ir kačių jautrumą BA.1 ir BA.2.
„Mes nustatėme BA.1 ir BA.2 spygliuočių struktūras komplekse su pelės ACE2 baltymu ir nustatėme tris likusias mutacijas, kurių reikia norint prisijungti prie pelės ACE2 baltymo, nurodant jų svarbą infekcijoms. Keista, kad dvi iš trijų reikalingų mutacijų buvo rastos pelėms pritaikytame SARS-CoV-2 ir nuo to laiko nebuvo nustatytos jokiuose SARS-CoV-2 variantuose iš kitų gyvūnų“, – sakė vienas iš tyrimo autorių.
Remdamiesi savo darbo duomenimis, kartu su ankstesniais darbais, mokslininkai iškėlė hipotezę, kad pelė greičiausiai yra pagrindinė gyvūnų šeimininkė omikrono variantų evoliucijai.
„Apibendrinant, mūsų duomenys atskleidžia struktūrinį ir biocheminį supratimą apie padidėjusį BA.2 antikūnų pernešamumą ir surišimą, taip pat galimą omikroninių variantų evoliucijos kelią. Mūsų duomenimis, jie iš žmogaus perėjo į katę, paskui – į pelę, o vėliau – į žmogų. Nors toks evoliucijos kelias yra labai spekuliatyvus, omikronų variantų gebėjimas užkrėsti ir išplisti tarp pelių ir galbūt kitų gyvūnų gali turėti svarbių pasekmių kuriant kontrolės strategijas kovojant su koronaviruso infekcija “, – padarė išvadą tyrimo autoriai.
Paaiškėjo, kad Omicron padermė taip skiriasi nuo ankstesnių, kad tiek skiepai, tiek sergančiųjų imunitetas prieš jį veikia tik ribotai. Jei panašus mutacijų kelias – per gyvūnus, gyvenančius šalia žmonių – pasikartos, galime tikėtis kitos padermės, galinčios apeiti ankstesnius antikoronavirusinio imuniteto variantus.
