SARS-Cov-2 koronaviruso antigenų, į kuriuos reaguoja žmogaus imuninė sistema, brėžiniai yra labai panašūs į SARS-CoV antigenų, sukėlėjusio SARS, brėžinius. Tai yra geras ženklas tiems, kurie kuria vakciną nuo koronaviruso.
La Hoya (Kalifornija, JAV) imunologijos instituto tyrėjai, padedami kolegų iš Craigo Venterio instituto, atliko pirmąjį tokio pobūdžio imuninio atsako į SARS-Cov-2 koronavirusą analizę. Straipsnis apie tai bus paskelbtas kovo 16 d. Leidinyje „ Cell, Host and Microbe“ .
Kai mūsų imuninė sistema susiduria su virusais ar bakterijomis, ji sutelkia dėmesį į nedidelius svetimų antigenų plotus – vadinamuosius epitopus. Būtent epitopai atpažįsta T ir B limfocitus „įsibrovėliais“ ir būtent prie šių vietų yra pritvirtinami antikūnai. Vakcinas kuriantiems ir tobulinantiems specialistams svarbu, kad būtų visas virusų epitopų žemėlapis ir jų imunogeniškumas (gebėjimas sukelti imuninį atsaką).
„Šiuo metu turime nedaug informacijos apie tai, kurie viruso fragmentai sukelia stabilią žmogaus [imuninės sistemos] reakciją“, – sako pagrindinis tyrimo autorius, biologijos mokslų daktaras Alessandro Sette. „Žinios apie tam tikrų virusinių regionų imunogeniškumą arba, kitaip tariant, į kurias viruso dalis reaguoja imuninė sistema ir kaip stipriai, yra tiesiogiai susijusios su perspektyvių vakcinų kūrimu“.
Nepaisant tam tikrų žinių apie žmonių reakciją į SARS-Cov-2 virusą spragų, koronavirusų šeimos epitopai, kaip ir imuninio atsako į juos ypatybės, yra gerai ištirti. Šiuo metu, be SARS-Cov-2, žmonių populiacijoje cirkuliuoja dar keturi koronaviruso štamai. Paprastai jie nesukelia rimtų ligų, o kartu jie sukelia maždaug ketvirtadalį sezoninių peršalimų.
Bet kas keleri metai atsiranda nauja padermė, sukelianti sunkią ligą, kaip buvo SARS-CoV (sukėlėjas SARS) 2002–2003 m. Ir MERS-CoV (Vidurinių Rytų kvėpavimo sindromo sukėlėjas), kurių protrūkis įvyko 2015 m. ir dabar SARS-CoV-2. Mokslininkų teigimu, „šviežias“ koronavirusas turi didžiausią panašumą į SARS-CoV – koronavirusą, kurio epitopai geriausiai apibūdinami.
Straipsnio autoriai tyrimui panaudojo turimus duomenis iš IEDB duomenų bazės, kurioje yra daugiau kaip 600 tūkstančių žinomų 3600 skirtingų virusų epitopų, taip pat informaciją iš virusų patogenų išteklių duomenų bazės. Mokslininkai išanalizavo žinomus SARS-CoV kamieno epitopus ir palygino juos su panašiomis SARS-CoV-2 antigenų vietomis.
„Mums pavyko palyginti 10 B ląstelių epitopų su naujuoju koronavirusu, ir dėl bendro didelio antigeninių sekų panašumo tarp SARS-CoV ir SARS-CoV-2 yra didelė tikimybė, kad tie patys regionai yra šiuose dviejuose kamienuose. imunodominantinis “, – komentuoja viena iš tyrimo autorių Alba Griffoni. Stuburo formos procesų glikoproteinuose buvo rasti penki panašūs epitopai – tie, kurie primena vainiko dantis ir suteikė pavadinimą koronavirusams. Trys panašūs epitopai buvo rasti viruso nukleokapside (baltymų ir RNR kompleksas), dar du – baltymo apvalkale. Be to, atliekant stuburo formos procesus ir nukleokapsidą, mokslininkai rado 17 panašių T ląstelių epitopų.
Tai, kad yra išsaugota daugybė dviejų koronaviruso padermių epitopų, teikia informaciją apie tuos, kurie dirba su vakcinomis nuo SARS-CoV-2. „Vakcinų strategijos, nukreiptos būtent į šiuos [konservatyvius] regionus, gali sukurti imunitetą, kuris ne tik kryžmiškai apsaugo [nuo skirtingų padermių], bet yra gana atsparus vykstančiai viruso raidai“, – sako Alessandro Sette.
